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游離DNA(cf DNA)質(zhì)控分析試劑盒(安捷倫 Agilent 5200,5300,5400)
cf DNA(cell-free DNA),是指游離于細(xì)胞外的DNA,在包括血清,血漿,唾液,腦脊液(CSF)和尿液的各種體液中均有發(fā)現(xiàn),cfDNA可以從健康以及各種疾病狀態(tài)下的個(gè)體中分離,有研究已經(jīng)證實(shí),腫瘤患者外周血中的cfDNA總量,要高于健康人,所以cfDNA含量增多,能起到一個(gè)較好的提示作用,可作為一個(gè)腫瘤疾病初篩的手段。除了用于癌癥早期診斷與后期評(píng)價(jià)癌癥藥物療效之外,也可用于孕婦無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)。當(dāng)孕婦懷孕的時(shí)候,胎兒的DNA也會(huì)同時(shí)釋放到母親的血液里頭去,這是當(dāng)前火熱的無(wú)創(chuàng)唐氏篩查的基礎(chǔ)。通過(guò)抽取母親的外周血測(cè)序分析其中的游離DNA就可以判斷胎兒是否存在整個(gè)染色體或者大片段DNA的變異。
目前發(fā)現(xiàn)cell free DNA的來(lái)源主要有兩種:一種是細(xì)胞主動(dòng)裂解(又叫細(xì)胞凋亡)過(guò)程中產(chǎn)生的“DNA ladder”式的片段化核酸,它們的大小基本上在150-200bp左右。分離cfDNA通常顯示三個(gè)片段:?jiǎn)魏诵◇w(?165bp),二核小體(?350bp)和三核小體片段(?565bp)。每個(gè)樣本都是不同的,樣品分析結(jié)果可以顯示一個(gè)到六個(gè)或更多個(gè)片段大小。另一種就是細(xì)胞被動(dòng)裂解,這種裂解的方式就有很多,既可以來(lái)源于外界物理或化學(xué)刺激引發(fā)的組織壞死,也可以是自身免疫系統(tǒng)對(duì)細(xì)胞殺傷作用,不同的是這個(gè)過(guò)程產(chǎn)生的核酸很大,會(huì)接近基因組DNA大小。無(wú)論是哪一種方式產(chǎn)生的cfDNA,都會(huì)進(jìn)一步在外周血中被快速清除,同時(shí)體內(nèi)的細(xì)胞裂解又會(huì)釋放新的游離DNA,這個(gè)動(dòng)態(tài)的過(guò)程會(huì)使得體內(nèi)的游離DNA維持在一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的較低的水平。
NGS技術(shù)的持續(xù)改進(jìn)使得使用信息豐富的游離DNA作為液體活檢的標(biāo)記。目前正在開(kāi)發(fā)針對(duì)癌癥,胎兒健康和各種遺傳疾病的有效、無(wú)創(chuàng)篩選,這是基于特定的cfDNA序列的存在與否。
AATI公司(安捷倫5200,5300,5400,AATI Advanced Analytical Technologies )為cfDNA質(zhì)量控制分析提供了多種解決方案。下面提供了幾種試劑盒,這幾種試劑盒有著不同的靈敏度和分辨率,能夠可靠地定量和鑒定cfDNA片段。
DNF-474 High Sensitivity NGS Fragment Analysis Kit
DNF-474高靈敏度NGS分析試劑盒能夠高分辨率的分離cfDNA片段,準(zhǔn)確可靠的得出片段大小以及定量分析。確定片段大小有助于確定從哪一種細(xì)胞和組織類型中釋放出的cfDNA,以及發(fā)生了什么類型的細(xì)胞死亡。這個(gè)試劑盒的檢測(cè)范圍比cfDNA片段要大,可以分離出任何片段DNA。完全分離出多種DNA并精確量化,當(dāng)cfDNA水平被用作疾病狀態(tài)的篩查工具時(shí),這是至關(guān)重要的。
DNF-488 High Sensitivity Genomic DNA Analysis Kit
DNF-488試劑盒可以分離cfDNA片段,能夠準(zhǔn)確的檢測(cè)出cfDNA片段以及定量分析。該試劑盒檢測(cè)范圍為1-20000bp。
DNF-477 High Sensitivity Small Fragment Analysis Kit
DNF-477能夠更精確的得出cfDNA片段大小并定量單、雙和三核的cfDNA片段,并具有很高的分離分辨率。
DNF-464 High Sensitivity Large Fragment 50 Kb Analysis Kit
DNF-464對(duì)所有三種常見(jiàn)的cfDNA片段提供了完整的分離,精確可靠的大小和定量分析。大范圍的一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是將片段DNA與cfDNA片段完全分離,以便對(duì)cfDNA樣本進(jìn)行精確的量化。該試劑盒還允許對(duì)任何可能的cfDNA片段進(jìn)行可視化。如果gDNA污染是一個(gè)值得關(guān)注的問(wèn)題,那么本試劑盒是用來(lái)分析cfDNA的推薦工具。
DNF-493 High Sensitivity Large Fragment Analysis Kit
提供完整的分離,精確可靠的大小以及準(zhǔn)確定量三種常見(jiàn)的cfDNA片段。75bp-20,000bp的分級(jí)范圍,允許將片段DNA片段與cfDNA片段完全分離,從而精確地量化了cfDNA樣本。DNF-493提供了比三核片段更大的任何cfDNA片段的分離和可視化。DNF-493是在更大的gDNA存在的情況下對(duì)cfDNA進(jìn)行分析的可靠選擇。