- 簡介
WAVE核苷酸片段分析技術是近年來發(fā)展起來的一項分析技術,它是分離核苷酸片段及分析檢測已知基因突變和SNP的技術平臺,其原理是在液相色譜儀的基礎上采用Transgenomic公司的DNA分離柱及相應的配套數(shù)據(jù)工作站,實現(xiàn)對DNA片段大小的分離,DNA堿基突變的檢測,寡核苷酸(OLIGO),RNA,反義-OLIGO和siRNA的分析和純化。
DHPLC變性高效液相色譜的商品化儀器—WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)作為一種常規(guī)分析工具,用來對雙鏈DNA片段大小及可能的未知SNP和突變進行快速分析及分離鑒定。
自2006年美國Transgenomic公司對WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)進行全面升級,推出WAVE4500系列產(chǎn)品,4500系列具有更快速精確的變溫控制系統(tǒng),每日最大處理樣品量為400個PCR產(chǎn)物,而數(shù)據(jù)處理時間僅為1小時,若采用Pooling的方式,紫外檢測器可提高通量10倍,而熒光檢測器可提高靈敏度100倍。
WAVE系列產(chǎn)品分為:WAVE4500、WAVE4500HT、WAVE4500HT-HS、WAVE MD、WAVE Oligo和WAVE Microbal Analysis System共計六個型號的產(chǎn)品。
WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)(DHPLC變性高效液相色譜)的核心技術在于:
1. DNA分離柱
? 無孔多苯乙烯-二乙烯基苯 (PS-DVB)共聚物微球(3微米)與C18形成穩(wěn)定的固相基質(zhì);
? pH值工作范圍: 2-14;
? 溫度工作范圍: 20-95℃;
? 可以在DNA非變性(50-52℃),部分變性(53-78℃)和完全變性(80℃)條件分析和分離核苷酸片段;
? DNA Sep分離柱壽命大于6000次進樣;
? 可完成從分析(0.1nmol)到制備(5mmol)大樣品濃度變化;
? 重復精度: £ 1%;
? 色譜柱可再生使用;
2. WAVEMaker WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)專用軟件包功能(安裝在主機計算機內(nèi)):
? 可預測DNA片段變性溫度(Tm值);
? 可預測DNA片段給定溫度下,每一不同位置堿基變性的百分比;
? 可根據(jù)不同DNA片段,控制WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)中緩沖液的梯度條件;
? 可預測給定DNA片段流出分離柱的保留時間;
? 可實時數(shù)據(jù)采集;
? 結(jié)果數(shù)據(jù)處理(RT-PCR);
? 幫助設計DNA片段PCR引物;
WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)(DHPLC變性高效液相色譜)主要用于:
? DNA片段已知和未知突變和多態(tài)性的篩查;
? 植物基因自動分析;
? 腫瘤流行病學的研究;
? 分子遺傳病學的研究;
? 法醫(yī)學和親子關系研究;
? 種群研究;
? 其他與基因相關聯(lián)疾病診斷的研究;
? 分子生物學技術質(zhì)量控制;
WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)(DHPLC變性高效液相色譜)性能指標:
? 雙鏈DNA片段大小分析: 分辨率優(yōu)于1/100; 片段大小范圍: 50-2000bp(DNA Sep分離柱溫度范圍:50-52℃);
? 突變檢測: DNA片段大小范圍:80-1000bp可檢測單堿基突變;
? 對未知的SNP和單個核苷酸突變, 系統(tǒng)檢測的準確率大于96%;
? 對已知的SNP和單個核苷酸突變, 系統(tǒng)檢測的準確率大于99.9%;
? 突變檢測DNA Sep分離柱溫度范圍:53-78℃;
? 高通量突變檢測: 8分鐘/樣;
? 寡核苷酸(oligo)質(zhì)量控制,DNA Sep分離柱溫度范圍: 80℃;
? 寡核苷酸(oligo)質(zhì)量控制: 5-80mer,可檢測單堿基差別;5-30mer,可檢測相同長度寡核苷酸中單堿基
序列的差別;
? RNA分析,DNA Sep分離柱溫度范圍: 80℃;
? RNA分析,檢測范圍: 200-5000nts,分辨率優(yōu)于1/100;
? WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)具備純化DNA、Oligo、 RNA的能力;
? WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)結(jié)果重復率可達99.9%以上;
WAVE核苷酸片段分析系統(tǒng)(DHPLC變性高效液相色譜)可用于以下出入境檢疫檢驗行業(yè)標準:
2010年第3期出入境檢驗檢疫行業(yè)標準